学校法人「加計学園」が愛媛県今治市に獣医学部を新設した計画をめぐり、林芳正文部科学相は２０日の閣議後会見で、県や市の職員らが平成２７年４月２日に柳瀬唯夫首相秘書官（当時）と面会する予定であることなどが記されたメールを公表した。文科省の内部調査により、印刷されたメールが省内で見つかった。
藤原豊・内閣府地方創生推進室次長（当時）が県職員らと面会し、藤原氏が「熱意をどれだけ示せるか」などと述べたとされている。愛媛県が「備忘録」として作成した文書と趣旨がほぼ一致するが、県の文書にあった「要請の内容は総理官邸から聞いている」といった文言は記されていなかった。
文科省によると、メールは４月２日、内閣府から文科省行政改革推進室の職員３人に送信されたが、メールのコピーはこの３人とは別の行革室職員が異動時に残していった個人ファイルから見つかった。「本日１５時から柳瀬総理秘書官とも面会するようです。概要は後でまとめてお送りします」と記載されているが、「概要」に関する文書は確認できなかったとしている。
